En zor dönem 2023-24 sezonuydu. ESPN'in 22 Nisan 2024 tarihli haberine göre De Jong eylülde Celta maçında burkulan ayak bileği yüzünden kasıma kadar 10 maç kaçırdı, martta dört maç daha yoktu. 21 Nisan 2024'te 3-2 kaybedilen El Clásico'da Federico Valverde ile girdiği pozisyonda sezondaki üçüncü ayak bileği sakatlığını yaşadı ve sezonun son altı maçında forma giyemedi.
2024-25'e de sakatlıkla başladı. Phillip Cocu, Nisan 2026'da kulübün sitesine verdiği röportajda De Jong'un o sezonun başında sakatlandığını, oynamaya devam etse de en iyi halinde olmadığını, son aylarda ise yeniden en iyi seviyesine döndüğünü söyledi. Kulübün Ekim 2025 açıklamasına göre De Jong 2024-25'i 46 maç ve 2 golle tamamladı.