Son sezonunda rolü küçüldü. BDFutbol'a göre 21 lig maçında yalnızca 4 gol attı ve 12 maçta kadroda olduğu hâlde oyuna girmedi. Mundo Deportivo bu sezonu “berbat” olarak niteledi. Takım ise kazanmaya devam etti: İspanya Süper Kupası, UEFA Süper Kupası, Kulüpler Dünya Kupası ve ikinci üst üste lig şampiyonluğu. Kulübün kaydına göre bu lig şampiyonluğu, Henry'nin Barça'daki son kupası oldu.
| Sezon | Kupa |
|---|---|
| 2008-09 | La Liga |
| 2008-09 | Kral Kupası |
| 2008-09 | Şampiyonlar Ligi |
| 2009-10 | İspanya Süper Kupası |
| 2009-10 | UEFA Süper Kupası |
| 2009-10 | Kulüpler Dünya Kupası |
| 2009-10 | La Liga |
Kaynak: BDFutbol ve FC Barcelona. Kulüp toplam yedi kupa sayıyor.